Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEC22CQ9BRL7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms