Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDF4Q9BRK5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms