Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHDC3Q9BQ90 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHDC3Q9BQ90 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms