Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGPAT1Q99943 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGPAT1Q99943 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms