Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS8Q99627 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms