Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCL13Q99616 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms