Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNKPQ96T60 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNKPQ96T60 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms