Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIN3AQ96ST3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIN3AQ96ST3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIN3AQ96ST3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms