Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPXM1Q96SM3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPXM1Q96SM3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms