Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS6KC1Q96S38 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS6KC1Q96S38 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms