Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LMTK3Q96Q04 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMTK3Q96Q04 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms