Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3Q96PU9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms