Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEDD4LQ96PU5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEDD4LQ96PU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEDD4LQ96PU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms