Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOX2Q96NM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOX2Q96NM4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms