Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FGD4Q96M96 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FGD4Q96M96 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms