Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RMDN2Q96LZ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN2Q96LZ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms