Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX27Q96L92 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms