Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
KCNH8Q96L42 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KCNH8Q96L42 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNH8Q96L42 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms