Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPZA3Q96KX2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPZA3Q96KX2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPZA3Q96KX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms