Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKNOX2Q96KN3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PKNOX2Q96KN3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PKNOX2Q96KN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms