Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
COG3Q96JB2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COG3Q96JB2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms