Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APIPQ96GX9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APIPQ96GX9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms