Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM44Q96DX7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM44Q96DX7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms