Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCC1Q96CN9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCC1Q96CN9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms