Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3DQ96BQ1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM3DQ96BQ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms