Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZNF428Q96B54 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms