Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC17Q96AE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC17Q96AE7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms