Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPTSSAQ969W0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms