Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM63Q969Q1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRIM63Q969Q1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRIM63Q969Q1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRIM63Q969Q1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRIM63Q969Q1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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TRIM63Q969Q1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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TRIM63Q969Q1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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TRIM63Q969Q1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM63Q969Q1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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