Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RFKQ969G6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RFKQ969G6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms