Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAVIN3Q969G5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAVIN3Q969G5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAVIN3Q969G5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms