Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO1Q92973 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms