Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEO1Q92859 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
NEO1Q92859 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEO1Q92859 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms