Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF4BQ92750 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF4BQ92750 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms