Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RGP1Q92546 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RGP1Q92546 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms