Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DNAAF4Q8WXU2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
DNAAF4Q8WXU2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms