Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SKA2Q8WVK7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKA2Q8WVK7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms