Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNIP1Q8TF40 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNIP1Q8TF40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNIP1Q8TF40 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms