Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACER1Q8TDN7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACER1Q8TDN7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms