Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BRSK1Q8TDC3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRSK1Q8TDC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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