Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MDM1Q8TC05 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MDM1Q8TC05 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms