Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEDD1Q8NHV4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms