Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP61Q8NHU2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CFAP61Q8NHU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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