Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MSANTD4Q8NCY6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD4Q8NCY6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms