Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00301Q8NCQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms