Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DTX3Q8N9I9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DTX3Q8N9I9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms