Protein–RNA interactions for Protein: Q8N988

ZNF557, Zinc finger protein 557, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF557Q8N988 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF557Q8N988 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF557Q8N988 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF557Q8N988 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms