Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC155Q8N6L0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC155Q8N6L0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms