Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IGSF1Q8N6C5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
IGSF1Q8N6C5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF1Q8N6C5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF1Q8N6C5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF1Q8N6C5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF1Q8N6C5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IGSF1Q8N6C5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms