Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCL2Q8N4E4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL2Q8N4E4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms